东海原甲藻是中国近海最典型的有毒赤潮藻。它能产生毒素，对渔业和生态平衡产生严重危害。当前对它的赤潮爆发机制仍然不清楚。本文通过转录组结合生理代谢分析，发现了一些重要的基因受到氮限制、不同氮源以及光的调控，但昼夜变化对其几乎无影响。研究还揭示东海原甲藻的尿素循环相关基因对氮和光的响应与模式硅藻显著不同。与氮转运和同化相关基因的组成性表达保证了东海原甲藻在各种环境下都能有效利用各种氮源，在浮游植物群落中提高了它的竞争力，可能是它经常引发赤潮的原因之一。